二酸化塩素は他の一般的な殺菌剤と異なり、欠点が少なく、あらゆる状況と用途に対応することが可能です。
殺菌の効果の点では、エタノールなどのアルコール系と異なり、ノロウイルスなどにも有効であり、研究施設の安全キャビネットなど、完全に微生物をゼロにしなければならない用途にも使用することができます。
さらに、二酸化塩素は常温でガス状の物質であり、従って、過酸化水素やグルタルアルデヒド、次亜塩素酸などのように噴霧器などを必要とせず空間の殺菌や消臭にも用いることができます。